Đặng Thúy Bình1*, Nguyễn Thị Bảo Châu2, Bùi Kim Lý2
1Viện Công nghệ sinh học và Môi trường, Trường Đại Học Nha Trang, *binhdangthuy@gmail.com
2Trường Đại học Nha Trang
TÓM TẮT: Cá trích có khoảng 50 giống gồm rất nhiều loài, phân bố rộng, chủ yếu sống ở tầng nước mặt, di chuyển thành từng đàn và không di cư xa. Mẫu cá trích Sardinella gibbosa Bleeker, 1849 được thu từ Phú Quốc, Khánh Hòa, Đà Nẵng và Cát Bà. Cây đa dạng loài được xây dựng dựa trên thuật toán
neightbour joining sử dụng trình tự vùng gen điều khiển (Control region-CR) và 16S của DNA ti thể của các quần đàn S. gibbosa. Mạng lưới haplotype được xây dựng dựa trên phần mềm Network sử dụng tính năng Network Draw. Kết quả cho thấy vùng gen điều khiển (1122 bp) của 80 cá thể có tổng số 32
haplotype được phát hiện với đa dạng haplotype là h=0,916±0,00041. Đối với gen 16S (550 bp) của 81 cá thể có tổng số 31 haplotype được phát hiện và đa dạng haplotype là h=0,804±0,0017. Mạng lưới haplotype cho thấy sự kết nối rộng rãi giữa các quần thể cá trích S. gibbosa dọc theo bở biển Việt Nam trừ quần thể ở Phú Quốc. Hệ thống dỏng chảy đại dương và dòng chảy sông Mê Kông được cho là rào cản sinh học cho sự phát tán ấu trùng và sự hình thành các quần thể cá trích theo vùng biển.
Từ khóa: Sardinella gibbosa, gen điều khiển, mạng lưới haplotype, Việt Nam.
NGHIÊN CỨU CẤU TRÚC QUẦN THỂ LOÀI CÁ TRÍCH Sardinella gibbosa Bleeker, 1849 (Clupeiformes: Clupeidae) TẠI VÙNG BIỂN VIỆT NAM
Related
- Comparative population genetics of swimming crab host (Portunus pelagicus) and common symbiotic barnacle (Octolasmis angulata) in Vietnam (02-9-2021 08:05:34)
- Identify and characterize the SNP markers for traceability of scallop spiny lobster Panulirus homarus (Decapoda, Palinuridae) in Vietnam (02-9-2021 07:54:59)
- Ghi nhận mới và mối quan hệ tiến hóa của Epiphyte (Melanothamnus thailandicus) trên rong sụn (Kappaphycus alvarezii) tại Khánh Hòa (02-9-2021 05:06:19)
- Nghiên cứu định loại Tôm hùm ở Việt Nam bằng mã vạch ADN (02-9-2021 05:28:18)
Others
- About us (17-7-2014 09:35:40)
- SVM30022GR0249 "Management and restoration mangrove forests in the north of Khanh Hoa province - Toward sustainable landscape" (25-10-2023 09:44:51)
- VINIF.2022.DA00021 "DNA metabarcoding and integrated information database - Implication for Ichthyoplankton survey and fisheries management in Vietnam" (25-10-2023 09:53:54)
- Riverscape Genetics to Inform Natural History of Exploited Fishes in the Lower Mekong River Basin (23-10-2017 11:43:14)